ビスフェノールAが結合したエストロゲン関連受容体γ PDB ID: 2E2R(PDBsum,RCSB PDB)
2E2R ビスフェノールA 選択 SITE(PDBsum) 選択 ‖ SITE(PDBsum)のみ表示$
2ZKC(ビスフェノールZ 結合) ビスフェノールZ 選択 SITE(PDBsum) 選択 ‖ SITE(PDBsum)のみ表示$
【他のエストロゲン受容体の例とそのSITE部分】
※PDBデータ中でSITE情報の記載がないものは1QKUのSITE情報と同一配列番号のアミノ酸を抜き出して作成 (PDBsumのものは当該データ)
1EREのChain A(女性ホルモン17β-エストラジオールを含む) SITE ‖ SITE(PDBsum)$
1ERRのChain A(骨粗鬆症治療薬ラロキシフェン〈raloxifene〉含む) SITE ‖ SITE(PDBsum)$
3ERDのChain A(ジエチルスチルベストロール〈diethylstilbestrol,DES〉を含む) SITE ‖ SITE(PDBsum)$
SITE(PDBsum)〈A鎖〉とSITE〈B鎖〉の同時表示 [data01]
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バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択
DNA/RNA選択 同バックボーン選択 RNA選択
リガンド選択 HB選択($印のみ)
[data01]について(初期表示はSITE(PDBsum)〈A鎖〉,SITE〈B鎖〉)
SITE(PDBsum)〈A鎖〉選択 SITE(PDBsum)〈A鎖〉のDES選択 SITE〈B鎖〉選択 SITE〈B鎖〉のDES選択
空間充填 球棒 球30% 球60%
スティック スティック(太) 針金
DNA/RNA(ATGCU)
アミノ色 CPK色 | 濃赤 濃青 緑 紫 水色
Jmol色 Rasmol色
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックス・βストランド)#
水素結合(太) OFF
背景・黒 灰 白 紺
※amino表示の凡例 ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO = 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 = ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別 SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP ※疎水性インデックス順 ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE ※等電点順 ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
# アミノ酸のコンホメーション選択性参照。
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