ecosci.jpサイト内では分類しにくいニュースな分子や,RCSB PDBの新規公開データなどを脈絡なく掲載します。
※Jmol表示制限のため,10件ずつ表示するように変更しました(上記書庫も順次修正します)。
※旧版で表示していた一部の参考データ(PDBsumなど)は今後追加します。
PDBデータ1gt0のPyMOLによる回転アニメ
ヘモグロビン構造の比較(何れもA鎖): ヒト(2hhb,デオキシヘモグロビン),ヤツメウナギ(2lhb,CN-結合),ヌタウナギ(1it3,CO結合)
[Hagfish - Wikipedia]
[Cytochrome P450 reductase - Wikipedia,Heme oxygenase - Wikipedia]
[Favipiravir - Wikipedia,Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase - Wikipedia]
鉄フタロシアニンが結合したヘム獲得タンパク質HasApのPDBsumデータ3w8o_WPC
[Phthalocyanine - Wikipedia]
鉄フタロシアニンが結合したHasAp 3w8oのPDBsumデータ
デイノコッカス・ラディオデュランスのDNA修復酵素2v1c(左)としんかい6500レゴ(中),チューブワームのヘモグロビン1yhu(右)
[Deinococcus radiodurans - Wikipedia]
アミノ酸残基の極性(上掲書 p.89)とI'/O'値の比較 → Jmolアミノ酸
ヘモグロビンβ鎖の立体構造例(4hhbのChain B)