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●レチナール(11-cis-レチナールとall-trnas-レチナールの同時表示) → モノはなぜ見える
11-cis-レチナール,all-trnas-レチナール,11-cis-ビタミンA,all-trnas-ビタミンA,β-カロテン
※1番上は生体分子模型Kawakami Model(ウシロドプシンPDB 3PQR)の11-cis-レチナールとall-trnas-レチナール
●ウシロドプシン(PDB 3PQR:メタロドプシンII) → 生体分子模型Kawakami Model(ウシロドプシンPDB 3PQR) | 出張講座・土曜講座のご案内
●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順(特性基 R)
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 | Log Pをポケットに!
PyMOLによる上記モデル表示例(Chain未分割;本間作成)
●光合成を司る光化学系II複合体の部分構造(PDB 4UB6のChain A) → 光合成に関係する生体分子PDB 3ARCの部分構造例 | Jmolトピック
Mn4CaO5クラスターの比較
●緑色蛍光タンパク質GFP(PDB 1HCJのChain A) → 緑色蛍光を発するタンパク質/GFP
◆参考サイトと参考文献
本ページ作者撮影の会場写真(「ヒカリ展」以外も含む;2014/11/07)
International Year of Light | Losing the Dark - Flat Screen Version
WATCH: Here's how eyes evolved 500 million years ago(ScienceAlert,2015/01/12)
※関連書籍例:サイモン・イングス,「見る ―眼の誕生はわたしたちをどう変えたか」,早川書房(2009)