【サイエンスアゴラ2019ブース出展ポスターより】3Dプリンタ模型で見るタンパク質と分子の『鍵と鍵穴』の関係 生物のもつ多くの機能を知る上で，多彩なタンパク質とそこに結合する小分子（リガンド）の「鍵と鍵穴」の関係を知ることはとても重要です。化学で分子に名前をつけたりその構造を知ることが大事なのも，その関係を知ることで納得できるでしょう。 3Dプリンタ模型「川上モデル」により「鍵と鍵穴」の関係を示す模型を製作し，手にしながら比較してその機構を理解できるようにしました。リガンドを囲んでいる周辺アミノ酸を親水性・疎水性がわかるように着色しているので，ベンゼン環などリガンドの各部分に近接しているアミノ酸の関係がよくわかると思います。 例えば女性ホルモン・男性ホルモン・環境ホルモンとその結合タンパク質，最近アメリカで問題になっている食品中のPFASと総称される一群の化学物質とその結合タンパク質の関係などを目の当たりにすることができます。 視覚・聴覚・味覚，医薬。生物エネルギー（光合成など）等々，多彩な生命活動がわずか20種類のアミノ酸によって支えられている一端を，「鍵と鍵穴」模型に触れることで実感してもらえたら幸いです。昨年の『分子が登場する本を読もう！』も引き続き展示します。

PyMOLによる鍵と鍵穴模型データ表示（アミノ酸はI/O値順着色）

Colors - Jmol

スタジオミダスによる模型製作用データ例
※参考キーワード：アロマターゼ（ Aromatase - Wikipedia 参照） → 性ホルモン

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リガンド（鍵）によって周辺アミノ酸の組成（鍵穴）が異なる例；GPCRの場合

  

  

      

    

    

  

    

      

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