冷たい飲み物が欲しくなる季節,連載36で取り上げたBCAA(Branched Chain Amino Acids,分岐鎖アミノ酸)入りの飲料のCMも引き続き元気です。そこで,今回はBCAAのロイシン,バリン,イソロイシンのうち,ロイシンに着目してロイシンが重要な働きをしているタンパク質の紹介。Leucine Zipper(ロイシンジッパー)といい,2本のらせん状のタンパク質分子が,各々に規則的に含まれている疎水的なロイシンによって接合構造が保たれているものです。
さらにその反対側では,塩基性アミノ酸が多くなっていてその部分で外側が酸性であるDNA(デオキシリボ核酸)をつかんでいるというのも,生体分子の面白さを存分に教えてくれるデータになっています。
なお,1文字アミノ酸配列から各種HTMLデータを作成する秀丸マクロを用いれば,下表のようにBCAAを色分けした配列の表を作成することができます。
Met | Lys | Arg | Arg | Ile | Arg | Arg |
---|---|---|---|---|---|---|
Glu | Arg | Asn | Lys | Met | Ala | Ala |
Ala | Lys | Ser | Arg | Asn | Arg | Arg |
Arg | Glu | Leu | Thr | Asp | Thr | Leu |
Gln | Ala | Glu | Thr | Asp | Gln | Leu |
Glu | Asp | Glu | Lys | Ser | Ala | Leu |
Gln | Thr | Glu | Ile | Ala | Asn | Leu |
Leu | Lys | Glu | Lys | Glu | Lys | Leu |
|
※amino表示の凡例 ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO = 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 = ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別 SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP ※等電点順 ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG |