◆ WIRED『THE BIOLOGY BIG BANG!』に寄せて ◆


生命科学。21世紀をサヴァイヴするために──『WIRED』VOL. 4発売に寄せて(WIRED.jp)

※写真左側の模型については,メタンハイドレートN1ノイラミニダーゼ(タミフル結合)PDB 2HU4参照

[TOPIC] WIRED.jp公開イベント『「未来生物学講義」特別編 生物学がぼくらの未来を変える!?』(2012/06/28,東京大学駒場キャンパス)開催! ※Facebook情報


RNAポリメラーゼレスベラトロール日本未来科学館展示 今後も追加します文献・参考ページ

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バックボーン 二次構造 DNA/RNA(ATGCU backbone

全選択 タンパク質選択  リガンド選択
DNA選択 T鎖(テンプレート鎖)選択 DNA backbone選択
RNA選択 RNA backbone選択

空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合表示
 
 
背景・黒 灰 白 
RNAポリメラーゼIIの構造1r9t
2006年ノーベル化学賞:真核生物の遺伝情報転写
分子モデルで見るノーベル賞/2006年 化学賞関連


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バックボーン 二次構造 DNA/RNA(ATGCU backbone

全選択 タンパク質選択  リガンド選択
DNA選択 T鎖(テンプレート鎖)選択 DNA backbone選択
RNA選択 RNA backbone選択

空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合表示
 
 
背景・黒 灰 白 
1r9tのChain A・N・R・Tのみ


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レスベラトロール
空間充填 球棒 スティック
   
背景・黒 灰 白 
※ポリフェノールの“フェノール”については
アルコールとフェノール参照


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バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド#
水素結合(太) OFF
 
 
背景・黒 灰 白 
チューブワーム由来ヘモグロビン1yhuRCSB PDB
(hemoglobin A1 chain,B chain,B1a chain,B2 chain 含む)
チューブワーム関連データのSITE例生命を知り生命に学ぶ参照
(後者ページは『THE BIOLOGY BIG BANG!』誌p.075の紹介書籍「生命の跳躍 進化の10大発明」とも関連)

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1yhu_HEM-OXY〈 161(A) 〉(ヘム+O2)→ PDBsum
I'/O'=1.0761
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

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1yhu_ZN〈 191(B) 〉→ PDBsum
I'/O'=2.1643
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 


「しんかい6500」LEGOと「はやぶさ」(チューブワームの赤い色はヘモグロビンによる)
※参考テレビ番組:NHKサイエンスZERO「熱水噴出! 深海に生命を探れ」(2011/01/15放映)
※参考:ヘモグロビン - 今月の分子(PDBj)Cooperation Makes It Easierにアニメーション

  
日本科学未来館の「しんかい6500」原寸大模型と『熱水噴出孔と生物群集発見』説明パネル



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