◆ WIRED『THE BIOLOGY BIG BANG!』に寄せて ◆


生命科学。21世紀をサヴァイヴするために──『WIRED』VOL. 4発売に寄せて（WIRED.jp）
※写真左側の模型については，メタンハイドレート，N1ノイラミニダーゼ（タミフル結合）PDB 2HU4参照

[TOPIC] WIRED.jp公開イベント『「未来生物学講義」特別編 生物学がぼくらの未来を変える!?』（2012/06/28，東京大学駒場キャンパス）開催！ ※Facebook情報

RNAポリメラーゼ｜レスベラトロール｜日本未来科学館展示 今後も追加します ‖ 文献・参考ページ


バックボーン　二次構造　DNA/RNA（ATGCU backbone）

全選択　タンパク質選択　　リガンド選択
DNA選択　T鎖（テンプレート鎖）選択　DNA backbone選択
RNA選択　RNA backbone選択
空間充填　球棒　球60％　スティック　針金
アミノ色　Chain色　CPK色

酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別
疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順
コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド）
 水素結合表示
　
　
背景・黒　灰　白　紺
RNAポリメラーゼIIの構造1r9t
※2006年ノーベル化学賞：真核生物の遺伝情報転写
※分子モデルで見るノーベル賞／2006年 化学賞関連


バックボーン　二次構造　DNA/RNA（ATGCU backbone）

全選択　タンパク質選択　　リガンド選択
DNA選択　T鎖（テンプレート鎖）選択　DNA backbone選択
RNA選択　RNA backbone選択
空間充填　球棒　球60％　スティック　針金
アミノ色　Chain色　CPK色

酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別
疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順
コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド）
 水素結合表示
　
　
背景・黒　灰　白　紺
同1r9tのChain A・N・R・Tのみ


レスベラトロール
空間充填　球棒　スティック
　　　
背景・黒　灰　白　紺
※ポリフェノールの“フェノール”についてはアルコールとフェノール参照


バックボーン　二次構造
全選択　タンパク質選択　リガンド選択
空間充填　球棒　球60％　スティック　針金
アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別
疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順
コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド）#
 水素結合（太）　OFF
　
　
背景・黒　灰　白　紺
チューブワーム由来ヘモグロビン1yhu → RCSB PDB
（hemoglobin A1 chain，B chain，B1a chain，B2 chain 含む）
※チューブワーム関連データのSITE例，生命を知り生命に学ぶ参照
（後者ページは『THE BIOLOGY BIG BANG!』誌p.075の紹介書籍「生命の跳躍　進化の10大発明」とも関連）


1yhu_HEM-OXY〈 161(A) 〉（ヘム＋O2）→ PDBsum
I'/O'＝1.0761
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順

背景・黒　灰　白　紺

1yhu_ZN〈 191(B) 〉→ PDBsum
I'/O'＝2.1643
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順

背景・黒　灰　白　紺


「しんかい6500」LEGOと「はやぶさ」（チューブワームの赤い色はヘモグロビンによる）
※参考テレビ番組：NHKサイエンスZERO「熱水噴出！ 深海に生命を探れ」（2011/01/15放映）
※参考：ヘモグロビン - 今月の分子（PDBj） …Cooperation Makes It Easierにアニメーション

  
日本科学未来館の「しんかい6500」原寸大模型と『熱水噴出孔と生物群集発見』説明パネル

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