◆ 低用量ピル(Jmol版) ◆
Chime版(1)(2)Jmolコンテンツリスト
多様なリガンドを含むエストロゲン受容体および関連受容体等のSITE比較
※本ページの分子モデルはMicrosoft EdgeのInternet Explorerモードで参照できます。

ピル関連化合物の分子モデル例(初期表示はエチニルエストラジオール)

バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 球60% スティック 針金 消去
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合表示
 
  
背景・黒 灰 白 
分類 例示モデルの分子式
●ピルの例
エチニルエストラジオール
(ethynyl estradiol)/卵胞ホルモン
C20H24O2;分子量=296.41
 融点=141-146℃
ノルエチステロン
(norethisterone,norethindrone)/黄体ホルモン
C20H26O2;分子量=298.43
 融点=203-204℃
レボノルゲストレル (-)-form
(levonorgestrel,LNG)/黄体ホルモン
[商品名:ノルレボ,プランB など]
※参考:17β-エストラジオールとレボノルゲストレルの同時表示
※レボノルゲストレル結合タンパク質例:3d90(レボノルゲストレルが結合したプロゲステロン受容体) 同PDBsumデータ3d90_NOG$
C21H28O2;分子量=312.45
 融点=205-207℃
デソゲストレル
(desogestrel,DSG)/黄体ホルモン
C22H30O;分子量=310.47
 融点=109-110℃
●経口避妊薬・緊急避妊薬の例;併用剤含む(国内未承認)
ミフェプリストン
(mifepristone;RU-486
※ミフェプリストン(RU-486)結合タンパク質例:2w8yのChain A(ミフェプリストンが結合したプロゲステロン受容体) 同PDBsumデータ2w8y_486$
C29H35NO2;分子量=429.59
ミソプロストール
(misoprostol;上剤と併用)
C22H38O5;分子量=382.53
酢酸ウリプリスタル
(ulipristal acetate;ella
C30H37NO4;分子量=475.62
◆参考:天然のホルモンの例
17β-エストラジオール
(17β-estradiol)/女性ホルモンの例
C19H28O2;分子量=288.43
プロゲステロン
(progesterone)/妊娠ホルモン(プロゲスチン)の例
C21H30O2;分子量=314.45
テストステロン
(testosterone)/男性ホルモンの例
C19H28O2;分子量=288.43


17β-エストラジオールとレボノルゲストレルの同時表示

レボノルゲストレルが結合したプロゲステロン受容体3d90
Jmolで見るトピックス分子で参照可能
 
PDBsumデータ3d90より
PDBsumのLigand-SITEデータ集で参照可能
  
[左・中]プロゲステロン受容体 2w8yChain Aの構造,および同データとAlphaFill構造 P60401データ掲載ページ)のPDBsumデータ
[右]PyMOLによる2w8yのChain AとAlphaFill構造 P60401の重ね合わせ



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