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生体分子関連ニュース | |
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人工設計DNA結晶例3gbiの12量体(A-D鎖×3)
※トピックス分子に掲載
ヒスチジンキナーゼとレスポンスレギュレーターの複合体3a0rの4量体(A・B鎖×2)
※トピックス分子に掲載
参考:DNAのG-四重らせん構造例1kf1
Telomere - Wikipediaに画像掲載のデータ
RecO-DNAの構造2rpfのModel 1(原子No.50・119削除)
※DNAとRNAのいろいろな姿に掲載(他に2rpd,2rpe,2rph参照)
〔左〕ペラミビル(peramivir),〔右〕ペラミビルを含むPDBsumデータ2f10_BCZより
※ペラミビルを含むPDBデータ例:2f10,2htu
aTrm5-tRNA(tRNALeu)複合体2zzm
※DNAとRNAのいろいろな姿に掲載
テラバンシン(telavancin;海外ニュースに掲載)
薬理色素NK-4(キノリン骨格3核シアニン系色素;2つのI-1は略,アルツハイマー治療薬に掲載)
参考:ウミホタルルシフェリン(トピックス分子に掲載)
P450構造例:α-ナフトフラボンを含むP450 1A2(CYP1A2)のデータ例2hi4
(トピックス分子にも掲載)
参考:易熱性エンテロトキシンの例1lt4(粘膜アジュバント関連データ例)
※海外ニュースに掲載
キサンチン酸化還元酵素の例1fo4
(トピックス分子に掲載)
ファトスタチン(トピックス分子に掲載)
アクチノヒビン(actinohivin)の構造例3a07
※HIVとエイズに掲載
スルホトランスフェラーゼの例
〔左〕1aquのChain A(17β-エストラジオール含む)
〔中・右〕水酸化PCBを含むエストロゲンスルホトランスフェラーゼの例1g3m(言及ブログ記事)
出発物質のEGCG
エリブリン(eribulin)
JASRIの研究で解析されたフェリチン(ウマ)構造例2z5rのPQSによる24量体(CdとPd含む)
※こちらでモデル参照可能
参考:BDNFの構造例1bnd
(海外ニュースに掲載)
阻害剤OM00-3(Chain C)が結合したβ-セクレターゼ1m4hのChain A
(トピックス分子に掲載)
ボルトの部分構造(First entry, chain A-M)2zuo(トピックス分子に掲載)
※ブログ記事(2009/01/16)参照
シクロプロプ-2-エンカルボン酸
(トピックス分子に掲載)
A型インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼPB1-PB2サブユニット3a1gのChain A・B
※Jmolで見るトピックス分子にPA-PB1サブユニット2znlとともに掲載
A型インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼPA-PB1サブユニット2znl
※Jmolで見るトピックス分子参照(PB1-PB2サブユニット3a1gも併載)
ナトリウム・カリウムポンプ2zxe
※Jmolで見るトピックス分子参照
CPS49(上掲Figure 1より
※分子で見る国際問題と海外ニュースにサリドマイド含め分子掲載
※サリドマイドの鏡像体については,2001年度 ノーベル化学賞 - 不斉触媒合成参照
阻害剤KNI-272結合HIV-1プロテアーゼの中性子構造解析データ2zye
〔左〕全体構造,〔右〕PDBsumデータ2zye_KNIにH・D原子追加(一部H・D原子省略,クリックで拡大)
※Jmolで見るトピックス分子参照
インフルエンザウイルス(A/Tokyo/3/67)のノイラミニダーゼ1nn2のPQSによる4量体
※Jmolで見るトピックス分子に構造掲載
1930年のインフルエンザにおけるヘマグルチニン1ruy(豚インフルエンザ,H1N1)
※分子で見る国際問題と海外ニュースにデータ掲載
p.191図5-4掲載2v0zのChain C(中央が高血圧治療薬アリスキレン)
※Jmolで見るトピックス分子にデータ掲載
Oct4・Sox2・DNA 複合体の例1gt0
※Jmolで見るトピックス分子にデータ掲載
ヒト由来ギャップ結合チャネル2zw3
※Jmolで見るトピックス分子にデータ掲載
GFPデータ例3gj2のChain A
※GFPは蛍光発生部分がタンパク質(黄色)の内部にあるというお話をイメージ
参考:同じ研究チームによる別データ例,チロシル-tRNA合成酵素のPDBsumデータ2zp1_IYRより(3-ヨードチロシン含む)
※PDBsumのLigand-SITE情報に掲載
TTHA1718データ2rogのModel 1(左,in cell)と2roeのModel 1(右,in vitro)
※トピックス分子にデータ掲載
ニッケル-鉄ヒドロゲナーゼの例2frvのChain S・L
※Jmolで見るトピックス分子に構造掲載
参考:梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)のリポタンパク質例2v84
サルコシン(sarcosine)
〔左〕下記ニュースのキャップスナッチング部分2w69A鎖,〔右〕本記事該当データ3ebjA鎖
※Jmolで見るトピックス分子に構造掲載,配列比較も参照
〔左〕キャップスナッチング(cap-snatching)部分のデータ2w69
〔右〕同データA鎖のCASTpによるポケット部位(大きい方から4データ,画像クリックで拡大)
※Jmolで見るトピックス分子に構造掲載,配列比較も参照
オーキシン結合TIR1ユビキチンリガーゼのPDBsumデータ例2p1p_IACより
※Jmolで見るトピックス分子参照
F-アクチン2zwh
タバコモザイクウイルスのデータ例2tmvのPQSによる49量体;画像クリックで拡大
※こちらでモデル参照可能
p.18図3を参考に作成した1jb0中のP700をつくるChl a/Chl a'(黄色)ヘテロ二量体の構造例(画像クリックで拡大)
※トピックス分子で分子参照可