◆ 今週の分子 ◆
連載102（2005/11/18〜）：対称構造を持つオリゴマータンパク質の例（PDBデータ1G31ほか）

　先日の名古屋出張（と言っても今年の出張旅費は徳島行きで使い切って私費ですが）書店巡りをして見つけた新刊本の表紙はまさに私向けのメッセージという思いでした。早速ネット書店で取り寄せて，対称構造を持つ生体高分子の形の面白さを知ってもらおうと作成しました。

※参考：生体高分子に見られる多角形など，PQSによるタンパク質複合体構造（Jmol版）


「カラー図説　タンパク質の構造と機能」の表紙に出てくるPDBデータ例
（初期表示はp.45図1-74(h)ヘプタマーの1g31；以下の括弧も同図のもの）

 バックボーン 二次構造 OFF
リガンド表示 OFF
水分子表示（*印のみ）　 OFF

全選択 リガンド選択 タンパク質選択
 空間充填 球棒 スティック OFF
CPK アミノ色 ｜ ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
疎水性インデックス順（タンパク質）
等電点順
 Dot Surface表示 OFF
水素結合（細） 同（太） OFF
光沢表示 OFF ｜ 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF ｜ 画像をクリップボードへコピー

※amino表示の凡例
ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR
ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO
＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR
ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG
HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP
※疎水性インデックス順
ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP
SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE
※等電点順
ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP
VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG

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