初期表示はテトロドトキシン（tetrodotoxin, TTX）

p.15： ダイヤモンド（diamond）　→ フラーレン p.27： ジギトニン関連データとして：7xziのChain A・B（ジギトニンとイノシトール6リン酸が結合したTOC-TIC超複合体中のCtap3・Ctap4〈Ctapは葉緑体トランスロコン関連タンパク質〉）　AJP（ジギトニン）選択　IHP（イノシトール6リン酸）選択　同PDBsumデータ7xzi_AJP[305(B)]$　→ 別トピック p.37： ナイロン6（nylon 6）の繰り返し単位 ｜ ナイロン66：ナイロン66（nylon 66）の繰り返し単位　→ 代表的な高分子 p.38： ポリエチレンテレフタラート（polyethylene terephthalate，PET）の繰り返し単位 p.39： ポリビニルアルコール（polyvinyl alcohol，PVA）の繰り返し単位 ｜ ビニロン（vinylon，VA部分＋ホルマール化部分） p.43：テトロドトキシン（tetrodotoxin, TTX） ｜ TDT（5,6,11-trideoxyTTX） ｜ TTXとTDTの同時表示　→ 別トピック[1]・[2] （今後も追記します） バックボーン　二次構造 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ） 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） ヒトの必須・非必須区別 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

※ジギトニン関連参考データ：
ジギトニンとイノシトール6リン酸が結合したTOC-TIC超複合体中のCtap3・Ctap47xziのChain A・BとPDBsumデータ
（Ctapは葉緑体トランスロコン関連タンパク質）

ポリエチレンテレフタラート（polyethylene terephthalate，PET）の繰り返し単位

※参考：テトロドトキシン（TTX）とその類縁体例 TDT（5,6,11-trideoxyTTX）

  
［左］TTXの作用機序模式図
［中・右］TTXが結合した電位依存性ナトリウムチャネルNa_v1.7 6j8jとそのPDBsumデータ

※関連情報：上掲誌発刊の化学同人は「一家に1枚」シリーズの周期表作成に貢献しており，
同周期表は令和7年度 科学技術分野の文部科学大臣表彰を受賞しました。
　→ 別トピック（2019年は国際周期表年）

  
［左］ネランドミラスト（nerandomilast）　［右］ピルフェニドン（pirfenidone）

※参考データ（阻害剤結合PDE4B構造例）：4nw7とPDBsumデータ

    
［左］オールアジンナノリングの例（C₄₂H₂₄N₁₂），理研プレスリリースの図に準拠
［中］[9]シクロパラフェニレン（[9]cycloparaphenylene，[9]CPP）
［右］[6]シクロパラフェニレン（[6]cycloparaphenylene，[6]CPP）

初期表示はピクロラム（picloram）

バックボーン　二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択　タンパク質選択　DNA/RNA選択　同backbone選択　リガンド選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

p.31 ニトロゲナーゼ／PDB 3U7Q：3u7qのChain A・B（ニトロゲナーゼ）　同PDBsumデータ3u7q_ICS（MoFe7S9C；HCA含む）　→ 鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例 p.25 ダイヤモンド：ダイヤモンド（diamond，C）の結晶構造　→ 2014年は世界結晶年！ p.28 ペンタセン：ペンタセン（pentacene）　→ モノはなぜ見える p.28 サリチル酸：サリチル酸（salicylic acid；サリチル酸-13Cでなく通常のサリチル酸）　→ 別トピック p.28 HSA（ヒト血清アルブミン）：HSA構造例 2bxdのChain A（R-ワルファリンが結合したヒト血清アルブミン）　同PDBsumデータ2bxd_RWF$　→ 別トピック p.28 ワルファリン：R-ワルファリン（R-warfarin）とS-ワルファリン（S-warfarin）の同時表示　R-ワルファリン（R-warfarin）　S-ワルファリン（S-warfarin）　→ 別トピック p.29 ベンゾフェノン：ベンゾフェノン（benzophenone）　→ 環境ホルモンとして疑われている化合物の分子情報 (1) p.41 トリクロロシラン：トリクロロシラン（trichlorosilane） p.42 リモネン：(R)-リモネン〈(R)-limonene，オレンジ香味〉　(S)-リモネン〈(S)-limonene〉　→ 分子モデルで見るノーベル賞 p.42 カフェイン：カフェイン（caffeine）　→ 別トピック p.53 2,4-D：2,4-D　→ 環境ホルモンとして疑われている化合物の例（以下2データも同） p.53 2,4,5-T：2,4,5-T p.53 TCDD：2,3,7,8-TCDD p.53 ピクロラム：ピクロラム（picloram） p.53 カコジル酸：カコジル酸（cacodylic acid） p.58 銀：金（Au）・銀（Ag）・銅（Cu）の結晶構造同時表示　→ 2014年は世界結晶年！

ニトロゲナーゼ3u7qのChain A・BとPDBsumデータ

R-ワルファリン（R-warfarin）が結合したHSA（ヒト血清アルブミン）例2bxdのChain AとPDBsumデータ

  
［左］トリクロロシラン（trichlorosilane）
［右］シリコンウェハ製造用単結晶ケイ素（科博『人工結晶展』で撮影）

  
［左］2,4-D　［右］2,4,5-T

    
［左］2,3,7,8-TCDD・2,3,7,8-TCDF・3,3',4,4',5-PeCBの同時表示（ダイオキシン類の毒性等価係数）
［中］ピクロラム（picloram）　［右］カコジル酸（cacodylic acid）

金（Au）・銀（Ag）・銅（Cu）の結晶構造

「量子と量子技術」PDF（「一家に1枚」シリーズでダウンロード可能）

シプロフロキサシン（ciprofloxacin）

シプロフロキサシン（ciprofloxacin）が結合し多剤排出ポンプRE-CmeB 8gjlとPDBsumデータ

イプトリアゾピリド（iptriazopyrid）が結合した4-ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ（HPPD）9koyのChain AとPDBsumデータ

  
［左］ペニシリンG（penicillin G）　［右］セフトリアキソン（ceftriaxone）

セフトリアキソン（ceftriaxone）が結合したβ-ラクタマーゼ6b68のChain BとPDBsumデータ
（リガンドでスティック表示がセフトリアキソン，球棒表示が分解構造例）

※β-ラクタマーゼ別データ例：セフタジジム（ceftazidime）が結合したβ-ラクタマーゼOXA-101 9ixrのChain AとPDBsumデータ
→別トピック

  
HARP12量体とtRNA前駆体の複合体8kd9；［左］上から見た図　［右］側面から見た図

  
左から レントセルチブ（rentosertib；ISM001-055），同分子結合レントセルチブ結合リン酸化酵素TNIK 8zmlのChain AとPDBsumデータ

初期表示はCas9-ガイドRNA-ターゲットDNAの複合体4oo8Chain A-C

p.8 GFP：1hcjのChain A（Green Fluorescent Protein）　→ 緑色蛍光を発するタンパク質／GFP p.11 クロロフィルa：クロロフィルa（chlorophyll a） p.12 セルラーゼ：3x2m（セルラーゼ，cellulase）　同PDBsumデータ3x2m_GLC-BGC-BGC-BGC-BGC$　→ 別トピック｜界面活性剤の種類 p.12 乳酸脱水素酵素：9iovのChain E-H・Q-T（ゴシポール〈gossypol〉が結合したヒトの乳酸脱水素酵素A）　同PDBsumデータ9iov_GO3$　→ 別トピック p.12 ピルビン酸：ピルビン酸（pyruvic acid） p.24 PET：ポリエチレンテレフタレート（ポリエチレンテレフタラート，polyethylene terephthalate，PET）の繰り返し単位　→ 代表的な高分子 p.43 Cas9-ガイドRNA-ターゲットDNAの複合体／図1：4oo8のChain A・B・C（Cas9-ガイドRNA-ターゲットDNAの複合体；Cell論文）　→ CRISPR関連生体分子データ p.44 IS621リコンビナーゼ／p.45 図2a：8wt6（IS621リコンビナーゼ；Nature論文）　Chain F（DBL）backbone選択　Chain G・H（ターゲットDNA）backbone選択　Chain I・J（ドナーDNA）backbone選択 p.49 アスピリン：アセチルサリチル酸（acetylsalicylic acid；商標名としてアスピリン）　→ 「スパイス、爆薬、医薬品　世界史を変えた17の化学物質」を読むために p.49 アセトアミノフェン：アセトアミノフェン（acetaminophen）　→ 別トピック p.49 チルゼパチド：7rgpのChain P・R（チルゼパチドが結合したGLP-1受容体，Kobilkaらによる）　Chain P（tirzepatide）選択　同Chain P（アミノ酸残基 1-31） ｜ 7rbtのChain P（アミノ酸残基 1-32）　［Tirzepatide - Wikipedia］（チルゼパチドは39アミノ酸残基のペプチド：配列 YXEGTFTSDY SIXLDKIAQK AFVQWLIAGG PSSGAPPPS　→ 別トピック バックボーン　二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択　タンパク質選択　DNA/RNA選択　同backbone選択　リガンド選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） ヒトの必須・非必須区別 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

    
［左］クロロフィルa（chlorophyll a）　　［中・右］クロロフィルaほか4種類のテトラピロールと関連川上モデル
→ 窒素から見る生命の世界

Cas9-ガイドRNA-ターゲットDNAの複合体4oo8のChain A-C　→ Cell論文

IS621リコンビナーゼ8wt6　→ Nature論文
※参考：『非常識にもほどがある！ブリッジRNAが橋渡しするDNA組換えメカニズム』（東京大学 先端科学技術研究センター）

  
［左］チルゼパチドが結合したGLP-1受容体7rgpのChain P・R（Chain Pのアミノ酸残基：1-31）
［右］同7rbtのChain P（アミノ酸残基：1-32）
※チルゼパチド（tirzepatide）は39アミノ酸残基のペプチド
配列 YXEGTFTSDY SIXLDKIAQK AFVQWLIAGG PSSGAPPPS：
Tyr X GluGlyThrPheThrSerAspTyrSerIle X LeuAspLysIleAlaGlnLysAlaPheValGlnTrpLeuIleAlaGlyGlyProSerSerGlyAlaProProProSer