※分子モデル表示にはプラグインのChimeが必要です（詳細とダウンロード方法）

1ereおよび3erdのCASTpデータで見るエストロゲン受容体
※CASTpは，PDB ID または Keyword Search（例えば receptor など），あるいはデータアップでポケット部位が探索可能なサイトです．

●1ere Chain AのCASTpデータから　　 Pocket 172構成アミノ酸選択 ｜ SITE選択 ｜ Ps1選択 1ere Chain A全体とPocket 172（薄緑）＋ 17β-estradiol（EST） …初期表示* 全ポケットデータ（Pocket 172のみ薄緑，他は黄色）＋ EST Pocket 172 ＋ EST Pocket 172構成アミノ酸残基 ＋ EST　《 左から3erdのPocket 70抽出 》 SITE部分 ＋ EST　《 同SITEから求めた Pocket s1（Ps1） ＋ EST 》 　※1ereにはSITE情報の記載がないので，同じestradiol受容体の1qkuのSITE情報と同一配列番号のアミノ酸を抽出． 　　→ 参考： Pocket 121 ＋ EST ｜ Pocket 121構成アミノ酸残基 ＋ EST ●3erd Chain AのCASTpデータから　　 Pocket 70構成アミノ酸選択 ｜ SITE選択 ｜ Ps1選択 3erd Chain A全体とPocket 70（薄緑）＋ DES（diethylstilbestrol） Pocket 1〜70データ（Pocket 70のみ薄緑，他は黄色）＋ DES Pocket 70 ＋ DES Pocket 70構成アミノ酸残基 ＋ DES SITE部分 ＋ DES　　《 同SITEから求めた Pocket s1（Ps1） ＋ DES 》 ●参考データ（1ereおよび他のエストラジオール受容体のSITE情報から） SITE ＋ 17β-estradiol表示 SITE選択 全体表示 (左欄のSITE選択は無効) ※上記橙字選択は有効 1ere，1err，3erd，3ertの各L+S重ね合わせデータ 　→ 別版 　　…タンパク質選択による表示変更無効 1ere： L ｜ S ‖ L+S 1err： L ｜ S ‖ L+S 3erd： L ｜ S ‖ L+S 3ert： L ｜ S ‖ L+S 1ereのChain A * 1errのChain A * 3erdのChain A 3ert 1qkuのChain A

タンパク質バックボーン 同・二次構造 リガンド表示 OFF 水分子表示（*印データのみ）　 OFF 全選択 リガンド選択 タンパク質選択 空間充填 球棒 球・大き目 スティック OFF CPK色 アミノ色 ｜ 薄緑 濃赤 濃青 ラベル表示 OFF ドット表面表示 OFF 静電ポテンシャル OFF 親油ポテンシャル OFF 水素結合（細） 同（太） OFF S-S結合（太） OFF S原子（Protein中）空間充填 光沢表示 OFF ｜ 光量30% OFF 背景・黒 背景・灰 背景・白 回転 OFF ｜ 画像をクリップボードへコピー 酸性・中性・塩基性アミノ酸区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 有機概念図I/O値順（特性基 R）| 同（アミノ酸） 等電点順 ※amino表示の凡例 ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO ＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝ ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別 SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP ※疎水性インデックス順 ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE ※有機概念図I/O値順（特性基 R） ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE ※同上（アミノ酸） GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE ※等電点順 ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG

各エストロゲン受容体のLigandのサイズとPocket Information
（単位は，Surface，AreaがŲ，Volumeがų）

PDB ID	Ligand	Data of Ligand#1		Pocket of Receptor			Pocket of SITE
		Surface	Volume	Pocket No.	Area	Volume	Area	Volume
1ere	17β-estradiol	312.08	265.83	172 (2)	785.10 (405.92)	1077.55 (573.28)	140.72	346.24
1err	raloxifene	501.50	421.98	68	988.74	1409.79	157.17	303.75
3erd	diethylstilbestrol	328.40	264.25	70	413.46	548.96	157.59	294.48
3ert	4-hydroxytamoxifen	471.01	383.53	33	800.31	1476.07	−	−
1qku	17β-estradiol	312.08	265.83	121	428.34	584.81	164.25	378.51

#1 Alchemy 2000で計算（市販分子科学計算ソフトウェアの比較参照）。Ligandの分子モデルはこちらで閲覧可。