- 認知症予防に抗生物質 大阪市立大「治験につなげたい」（朝日，2016/03/30）
- 抗生物質リファンピシンに認知症予防効果あり－大阪市大ら（QLifePro医療ニュース，2016/03/31）
- Structures of the multidrug exporter AcrB reveal a proximal multisite drug-binding pocket（Nature，2011/11/27） ※下掲3aodについて
- リファンピシン - Wikipedia
- 下掲ミノサイクリン関連記事
- 他のAcrB構造例
- 抗生物質分子データ集（本サイト） ｜ アルツハイマー病治療薬
［Rifampicin - Wikipedia］
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リファンピシン（rifampicin） ※参考（リファンピシン結合タンパク質例）： 3aod*（多剤排出タンパク質AcrB） リファンピシン選択 ミノサイクリン選択 同PDBsumデータ3aod_RFP（リファンピシン）$ 同PDBsumデータ3aod_MIY（ミノサイクリン）$ ［Multiple drug resistance - Wikipedia，Minocycline - Wikipedia］ 8qzlのChain A（阻害剤BDM91288が結合した多剤排出タンパク質AcrB） 同PDBsumデータ8qzl_lp$ ※参考（ミノサイクリン）： ミノサイクリン（minocycline） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］リファンピシン（rifampicin） ［中］リファンピシンが結合した多剤排出タンパク質AcrB例3aod ［右］同PDBsumデータ
※AcrB関連情報例： Nature記事（2011/11/27） ｜ 今月の分子 No.95 - 多剤耐性輸送体（PDBj，2007/11）
ミノサイクリン（minocycline）と同分子結合3aodの同PDBsumデータ
阻害剤BDM91288が結合した多剤排出タンパク質AcrB 8qzlのChain AとPDBsumデータ
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●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
- 桜井弘 編，「生命元素事典」，オーム社(2006)
- 桜井 弘，「元素111の新知識 第2版」，講談社ブルーバックス(2009)
- 鉛中毒 - Wikipedia ※“鉛中毒における毒性の原因は…特に造血組織でアミノレブリン酸脱水酵素のSH基に結合して貧血を起こすことが典型例”については下図参照（ALADとPKCの違い）。
- 鉛中毒: 中毒: メルクマニュアル 家庭版
- 生体分子の構成元素（本サイト） ｜ 別トピック（5-アミノレブリン酸）
［ALAD - Wikipedia，Lead poisoning - Wikipedia］
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1qnvの8量体（Chain A×8；5-アミノレブリン酸脱水素酵素） 同PDBsumデータ1qnv_PB [400]（Pbイオン）$ 3twy（タンパク質キナーゼC） 同PDBsumデータ3twy_PB [11]（Pbイオン）$ ［Protein kinase C - Wikipedia］ ※参考： 5-アミノレブリン酸（5-aminolevulinic acid；δ-aminolevulinic acid；5ALA） ｜ ポルフィリン（porphyrin） ｜ 5-アミノレブリン酸（5ALA）とポルフィリンの同時表示 → 別トピック ※参考（Pbを含む他のPDBデータ例；生体分子の構成元素より） 1b6g CSB（Pb含む）選択 1v0d* バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 Pb選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］1qnvの8量体（Chain A×8；5-アミノレブリン酸脱水素酵素）
［中］1qnv（ALAD，上）と3twy（PKC，下）それぞれのPDBsumデータ
［右］5-アミノレブリン酸（5ALA）とポルフィリン → 別トピック
- 新潟の地酒と日本のお酒 喫酒 ささ泉 - Facebook ※上掲カフェゲストによる日本酒紹介記事の多くで香りについて書かれていることから，代表的香り成分例とエタノールを以下に。
- 第56回サイエンスカフェにいがた『酒造りは米作りから、そして人つくり』（2012/02/25開催） ※日本酒の香気成分例としてカプロン酸エチルを紹介。
- においの豆知識（7） 発酵食品のにおい(3) ─日本酒のかおり─（食品分析開発センター）
- 堤 浩子，『清酒酵母の香気生成の研究』，生物工学会誌，89(12)，717-719(2011) [PDF]
- 日本酒はなぜフルーツの香りがするの？ 発酵の過程でできる成分が…（朝日，2022/10/15）
- カプロン酸エチル - Wikipedia ｜ 酢酸イソアミル ｜ エステル ｜ 日本酒
- 日本酒の香りを決定付ける重要な役割を担う酵母の話（ダイヤモンド・オンライン，2010/07/23）
- 香りの分子事典・解説編（本サイト） ｜ 果物の香りをつくる／エステル類ほか
［Ethyl hexanoate - Wikipedia，Ester - Wikipedia］
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空間充填 球棒 球30％ 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
カプロン酸エチル（ethyl caproate；ヘキサン酸エチル ethyl hexanoate） 酢酸イソアミル（isoamyl acetate；酢酸イソペンチル isopentyl acetate） ［Isoamyl acetate - Wikipedia］ エタノール → アルコールとフェノール |
カプロン酸エチル（ethyl caproate；ヘキサン酸エチル ethyl hexanoate）
- Structural basis of lenalidomide-induced CK1α degradation by the CRL4CRBN ubiquitin ligase（Nature，2016/02/24）
※以下別トピックより転載 - RCSB PDB 2014/12/17 新規公開データより：4v30 Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex with Lenalidomide ※サリドマイド誘導体のレナリドミド結合データ。他にサリドマイド結合の4v2yほか。
- Thalidomide mimics uridine binding to an aromatic cage in cereblon（Journal of Structural Biology，2014/12）
- サリドマイドの標的タンパク質「セレブロン」の三次元構造を解明 ～免疫調整剤に関する研究の促進と新薬開発にむけて大いに期待～（奈良先端科学技術大学院大学，2014/08/12）
- セルジーン 多発性骨髄腫治療薬レナリドミド 国内P2で未治療患者の効果を確認 適応拡大申請へ（ミクスOnline，2014/12/11）
- 構造生物学：サリドマイドの二通りの作用機構（Nature ハイライト，2014/08/07）
- レナリドミド関連別研究例：Evaluating the impact of CRBN mutations on response to immunomodulatory drugs and novel CRBN-binding agents in myeloma（Blood，2025/01/22） [NEW!] ※2025/01/29公開9fjx（下掲）
- レブラミド（レナリドミド）の作用機序：多発性骨髄腫治療薬（役に立つ薬の情報～専門薬学）
- サリドマイド - Wikipedia
- 参考（サリドマイド関連）：分子モデルで見るノーベル賞（本サイト） ｜ 別トピック[1]・[2]
［Lenalidomide - Wikipedia，Thalidomide - Wikipedia，Ubiquitin ligase - Wikipedia，DDB1- Wikipedia，Cereblon- Wikipedia，Casein kinase 1- Wikipedia］
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5fqdのChain A-C（(S )-レナリドミドが結合したDDB1-CRBN〈CRL4CRBN E3ユビキチンリガーゼ構成成分〉-CK1α複合体） 同PDBsumデータ5fqd_LVY$ ※参考：別トピックのレナリドミド結合PDBデータほか 4v30のChain A（(S )-レナリドミドが結合したセレブロン） 同PDBsumデータ4v30_LVY [151(A)]$ 9fjxのChain B（(S )-レナリドミドが結合したセレブロン） 同PDBsumデータ9fjx_LVY$ PDBsumデータ4v2y_EF2$（(S )-サリドマイドが結合したセレブロン） (S )-サリドマイド ｜ (R )-サリドマイド ｜ 両分子同時表示 バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（IL-18）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］(S)-レナリドミド（(S)-lenalidomide）
［中・右］(S )-レナリドミドが結合したDDB1-CRBN5fqdのChain A-CとPDBsumデータ5fqd_LVY
(S )-レナリドミドが結合したセレブロン9fjxのChain BとPDBsumデータ
- がん再発を阻止するナノテク抗癌剤の開発に成功 東京大学 （大学ジャーナル，2016/04/30）
- 東大、がん幹細胞を狙い撃ちするナノテク抗がん剤を開発（大学ジャーナル，2016/04/18）
- スタウロスポリン - Wikipedia
- Protein kinase inhibition by staurosporine revealed in details of the molecular interaction with CDK2（Nature Structural Biology，1997/10/01） ※下掲1aq1について
- 抗生物質分子データ集（本サイト） ｜ アスベスト（石綿）問題 ｜ 別トピック（2015年ノーベル生理学・医学賞）
［Staurosporine - Wikipedia］
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スタウロスポリン（staurosporine） ※参考（スタウロスポリン結合タンパク質例）： 1aq1（阻害剤スタウロスポリンが結合したサイクリン依存性キナーゼ2） 同PDBsumデータ1aq1_STU（スタウロスポリン）$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
スタウロスポリン（staurosporine，左）と同分子が結合した1aq1のPDBsumデータ（右；上掲ニュースとは無関係）
［Aramid - Wikipedia］
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空間充填 球棒 球30％ 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
新規バイオ由来芳香族ポリアミド (1)（資料 [1] の高分子 10） 同 (2)（資料 [1] の高分子 7；n=4） ※他のアラミドの例 → 代表的な高分子 ケブラー（Kevlar） |
新規合成バイオ由来芳香族ポリアミド (1)（筑波大学プレスリリース [PDF] の高分子 10）
［W-18 - Wikipedia］
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空間充填 球棒 球30％ 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
W-18〔4-クロロ-N-[1-[2-(4-ニトロフェニル)エチル]ピペリジン-2-イリデン]ベンゼンスルホンアミド〕
- Protein-directed self-assembly of a fullerene crystal（Nature Communications，2016/04/26）
- Sir Harry Kroto, Nobel prize-winning chemist, dies at 76（The Guardian，2016/05/02）
- Tributes for Nobel prize chemist Harry Kroto（BBC，2016/05/04）
- フラーレン - Wikipedia ∥ Harry Kroto
- フラーレン（本サイト） ｜ 別トピック
［Fullerene - Wikipedia，Protein design - Wikipedia］
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5et3の4量体（Chain A・B×2；フラーレン（C60）結合デノボデザインペプチド） 同PDBsumデータ5et3_60C [101(A)] ｜ 5hknのPDBsumデータ5hkn_60C [101(B)] ｜ 5hkrのPDBsumデータ5hkr_60C [101(B)] フラーレン（C60） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］フラーレン（C60）結合デノボデザインペプチド5et3の4量体（Chain A・B×2） ［右］同PDBsumデータ
- Tetrabromobisphenol A Is an Efficient Stabilizer of the Transthyretin Tetramer（PLoS ONE，2016/04/19）
- 環境保健クライテリア 172 テトラブロモビスフェノールA(TBBPA)および誘導体（国立医薬品食品衛生研究所）
- テトラブロモビスフェノールA - 日本化学物質安全・情報センター [PDF]
- はっ水剤・難燃剤の生物体内蓄積性（本サイト） ｜ 環境ホルモンとして疑われている化合物の例 ｜ 多様なリガンドを含むエストロゲン受容体および関連受容体等のSITE比較 ｜ アルツハイマー病治療薬 ｜ 別トピック
［Tetrabromobisphenol A - Wikipedia，Transthyretin - Wikipedia］
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5hjg（TBBPAが結合したトランスサイレチン） 同PDBsumデータ5hjg_XDI TBBPA（テトラブロモビスフェノールA，tetrabromobisphenol A） ※参考（その他のTBBPA結合PDBデータ例）：3oswのChain A（TBBPAが結合したペルオキシソーム増殖剤活性化受容体γ） 同PDBsumデータ3osw_XDI バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
テトラブロモビスフェノールA（TBBPA）が結合したトランスサイレチン5hjgと同PDBsumデータ
- 〈速報〉プリンスさん警察捜査の焦点は薬の過剰処方（朝日，2016/05/06）
- 歌手プリンスの死因"オピオイド"の危険性 過剰摂取が突然死をもたらしうる（プレジデントオンライン，2018/06/19）
- ドクター・レディーズ・ラボ、米でオピオイド中毒治療薬発売へ（日経，2018/06/19） ※“「ブプレノルフィン」と「ナロキソン」を含有する医療用麻薬「オピオイド」中毒治療薬の後発薬を米国内で販売する承認を受けたと発表”。
- 薬物の過剰摂取による死亡率、米が最悪 12カ国・地域調査（CNN.co.jp，2018/11/18） ※“フランスでは、鎮痛剤「ブプレノルフィン」の処方者に対する制限をなくしたことで、オピオイドの過剰摂取による死亡率が79％減少”。
- 世界の自殺率急増に警鐘、「HIV並みの予防策を」（AFPBB News，2018/06/15） ※“説明は難しいが、その原因の一部にはオピオイド系薬物のまん延に加え、他の先進国と比べて打撃の大きい経済的要因があるかもしれない”。
- 自閉スペクトラム症の薬物治療へ新たな光！ ～鎮痛作用を示さない低用量オピオイドが社会性に関わる機能を改善～（広島大学，2025/02/10） [NEW!] ※“ブプレノルフィンは、鎮痛作用を示さない低用量域において、ASDモデル動物の社会性行動の低下を改善”。
- 鎮痛剤 - Wikipedia
- 危険ドラッグ（本サイト） ｜ 話題の制がん剤・抗がん剤（ナロキソン） ｜ 別トピック（ヘロイン，オキシコドンなど）
［Oxycodone/paracetamol - Wikipedia］
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空間充填 球棒 球30％ 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
パーコセット（Percocet；オキシコドン・アセトアミノフェン〈パラセタモール〉の同時表示） オキシコドン（oxycodone） ［Oxycodone - Wikipedia］ ｜ 参考：ヘロインとオキシコドンの同時表示 アセトアミノフェン（acetaminophen；パラセタモール，paracetamol） ［Paracetamol - Wikipedia］ ナロキソン（naloxone） ［Naloxone - Wikipedia］ ブプレノルフィン（buprenorphine） ［Buprenorphine - Wikipedia］ |
［左］パーコセット（Percocet；オキシコドン・アセトアミノフェン〈パラセタモール〉の同時表示） ［右］ブプレノルフィン（buprenorphine）