◆ Jmolで見るトピックス分子(28-2) ◆

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1201-12101211-12201221-12301231-12401241-12501251-12601261-12701271-12801281-12901291-1300
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Vol.1235678データ名一覧
→ 最近の本サイトコンテンツから: 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2|COVID-19)情報川上モデル「鍵と鍵穴」模型元素・分子が登場する本を読もう!

ecosci.jpサイト内では分類しにくいニュースな分子や,RCSB PDBの新規公開データなどを脈絡なく掲載します。
※Jmol表示制限のため,10件ずつ表示するように変更しました(上記書庫も順次修正します)。
※旧版で表示していた一部の参考データ(PDBsumなど)は今後追加します。
※本ページの分子モデルはMicrosoft EdgeでInternet Explorerモードにして参照できます。
※分子モデルが表示されない場合は分子表示窓右の別データ表示ボタンを押してみてください。
※PDBsumデータでファイル名*_lpであるものはLigPlot+ v.2.2で取得したものです。


  1. Sanofiのacoziborole、睡眠病治療でEU委員会の支持を獲得(Investing.com,2026/02/27) [NEW!]

    アコジボロール(acoziborole)
    I = 440, O = 360, I/O = 1.222  ※B(ホウ素)は I = 60, O = 0 で計算
    空間充填 球棒 球60% スティック 針金 消去
    CPK色 Jmol色 Rasmol色
     
    背景・黒 灰 白 


    アコジボロール(acoziborole)



    アミノ酸および特性基の親水性・疎水性Log Pをポケットに!


  2. Computational redesign of the heme acquisition protein HasA for enhanced thermostability while retaining its ability to bind synthetic metalloporphyrins(Chemistry Letters,2025/12/16) [NEW!] ※2026/03/04公開9xoh

    鉄テトラフェニルポルフィリンが結合したヘム獲得タンパク質HasA 9xohのChain A
    9xohのChain A(鉄テトラフェニルポルフィリンが結合したヘム獲得タンパク質HasA) 同PDBsumデータ9xoh_MQP$
    バックボーン 二次構造
    全選択 タンパク質選択 リガンド選択 HB選択($印のみ)
    空間充填 球棒 球60% スティック 針金 消去
    アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

    酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
    疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
    コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
    ヒトの必須・非必須区別
    水素結合表示
     
      
    背景・黒 灰 白 


    鉄テトラフェニルポルフィリン(Fe-TTP)が結合したヘム獲得タンパク質HasA 9xohのChain AとPDBsumデータ


  3. 使われるはずがない「ビンクリスチン」検出 埼玉県立小児医療センターの抗がん剤注射で1人死亡2人重体(東京新聞,2026/03/11) [NEW!] ※ニュース多数

    ビンクリスチン(vincristine)
    I = 837, O = 920, I/O = 0.910
    vincristine - Wikipedia
    ビンクリスチン(vincristine) I/O = 0.910
    ※参考(ビンクリスチン結合タンパク質例):8zbs(MRP4〈ABCC4〉) 同PDBsumデータ8zbs_R1Q$ [ABCC4 - Wikipedia

    バックボーン 二次構造
    全選択 タンパク質選択 リガンド選択 HB選択($印のみ)
    空間充填 球棒 球60% スティック 針金 消去
    アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

    酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
    疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
    コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
    ヒトの必須・非必須区別
    水素結合表示
     
      
    背景・黒 灰 白 

      
    左から ビンクリスチン(vincristine),
    同分子結合タンパク質例MRP4(ABCC4)8zbsとPDBsumデータ


  4. An AI-based approach accelerates the discovery of protein-protein interaction modulators targeting NCS-1(European Journal of Medicinal Chemistry,2026/03/05) [NEW!] ※2026/03/11公開9t0h(下掲)

    ジピリダモール(dipyridamoe;FDA承認薬)が結合したNCS-1 9t0h
    Neuronal calcium sensor-1 - Wikipedia
    9t0h(ジピリダモール(dipyridamole;FDA承認薬)が結合したNCS-1) 同PDBsumデータ9t0h_H9F$

    バックボーン 二次構造
    全選択 タンパク質選択 リガンド選択 HB選択($印のみ)
    空間充填 球棒 球60% スティック 針金 消去
    アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

    酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
    疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
    コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
    ヒトの必須・非必須区別
    水素結合表示
     
      
    背景・黒 灰 白 


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