ecosci.jpサイト内では分類しにくいニュースな分子や,RCSB PDBの新規公開データなどを脈絡なく掲載します。
※Jmol表示制限のため,10件ずつ表示するように変更しました(上記書庫も順次修正します)。
※旧版で表示していた一部の参考データ(PDBsumなど)は今後追加します。
※Jmol利用コンテンツはWindows 10でもInternet Explorer 11で閲覧できます。
温度感受性TRPチャネルTRP1 6pw4とそのPDBsumデータ
初期表示:蛍光増白剤 DAS1(2ナトリウム塩)
ヘリオロドプシン6is6(all-transレチナールはLys238に結合)とそのPDBsumデータ(レチナール;1-オレオイル-R-グリセロールが結合)
[Ribonucleotide reductase - Wikipedia,Deoxyadenosine triphosphate - Wikipedia]
dATPが結合したリボヌクレオチド還元酵素3uusとそのPDBsumデータ
[左]HIF-1αインヒビター1h2nの2量体(Chain A×2;Sir Peter J. Ratcliffeらによる)
[右]HIF-1α-VHLタンパク質-エロンギンB-エロンギンC複合体1lm8(William G. Kaelin Jr.らによる)
シトクロムbd型呼吸酵素6rkoとそのPDBsumデータ
[Lasmiditan - Wikipedia,5-HT1F receptor- Wikipedia]
ラスミジタン(ラスミディタン,lasmiditan)
抗片頭痛薬ラスミジタンが結合した5-HT1F受容体7exdのChain RとそのPDBsumデータ
[DOT1L - Wikipedia]
18-クラウン-6が結合したDOT1Lタンパク質6in3とそのPDBsumデータ
[Phospholipase A2 - Wikipedia]
コブラ毒由来のホスホリパーゼA2 1pobのChain A(黄色球はシステイン中の硫黄原子)とそのPDBsumデータ
[Amyloid beta - Wikipedia]
[左]アルツハイマー病患者の脳から得られたアミロイドβ線維前駆体タンパク質6shs<(残基番号1-40 → Nature Communications論文)
[右]in vitroでのアミロイドβ構造例2naoのModel 1(残基番号1-42 → PNAS論文)