ecosci.jpサイト内では分類しにくいニュースな分子や,RCSB PDBの新規公開データなどを脈絡なく掲載します。
※Jmol表示制限のため,10件ずつ表示するように変更しました(上記書庫も順次修正します)。
※旧版で表示していた一部の参考データ(PDBsumなど)は今後追加します。
※Jmol利用コンテンツはWindows 10でもInternet Explorer 11で閲覧できます。
4qyz(空間充填がcrRNA,小さめの球表示が標的ssDNA)
著者の佐藤健太郎さんにサイエンスカフェにいがた『国道って何だろう』(2015/01/24,ジュンク堂書店新潟店)でお話いただきます。
[Teixobactin - Wikipedia]
テイクソバクチン(テキソバクチン,teixobactin)
[KaiC - Wikipedia,Circadian rhythm - Wikipedia]
[Metformin - Wikipedia]
[Bimatoprost - Wikipedia,Prostaglandin-F synthase - Wikipedia]
[Cytochrome P450 - Wikipedia,Quinine - Wikipedia]
[左]「GoogleドライブとChem3D for iPad/RCSB PDB Mobileで分子を見る」によるキニーネとモーベインA・Bの同時表示
[右]キニーネ(quinine)が結合したシトクロムP450 2D6 4wnvのPDBsumデータ
2014年は世界結晶年!(様々な結晶構造)
[Hydrogenase - Wikipedia]
[左]4u9h(大きい球棒表示が[NiFe]活性部位)
[右]PDBsumデータの比較(4u9h_NWNと2frv_FCO-O;アミノ酸のSを黄色で表示)
[Toll-like receptor - Wikipedia]
[Xanthohumol - Wikipedia]
[左]キサントフモール(xanthohumol)
[右]フムロン(humulone)とイソフムロン(isohumulone;異性体あり)の同時表示