ステビオール-19-O-グルコシド（steviol-19-O-glucoside）とステビオサイド（stevioside；ステビア甘味成分の例）

  
ステビオール-19-O-グルコシドが結合したイネ由来の糖転移酵素 OsUGT91C1 7es1とPDBsumデータ

クローディン4とエンテロトキシンC-CPEの複合体5b2gのChain A・B

  
左から プテロスチルベン（pterostilbene），同分子結合データ例の細胞死関連プロテインキナーゼ1（DAPK1）8ie7とPDBsumデータ

  
［左］LNGタンパク質とコブラ毒素α-コブラトキシンの複合体9bk5
［右］α-コブラトキシンが結合したニコチン性アセチルコリン受容体1yi5
※何れも黄色球表示はα-コブラトキシン中のS原子

参考図：ニコチンが結合したヒトα3β4ニコチン性アセチルコリン受容体6pv7のChain A-Eと
そのPDBsumデータ（AT-1001結合の6pv8との比較）
→ 別トピック

U6 snRNAとTUT1の複合体9j8p

  
［左］ガバペンチン（gabapentin）
［中・右］同分子が結合した分岐鎖アミノ酸アミノトランスフェラーゼ1（BCAT1）2coiのChain AとPDBsumデータ

TPPリボスイッチアプタマードメイン（RNA）9c6kとPDBsumデータ

  
スゼトリギン（suzetrigine）

参考図（ナトリウムチャネル構造例）：カンナビジオール（cannabidiol，CBD）結合電位依存性ナトリウムチャネル
Na_v1.7 8g1aのChain AとPDBsumデータ
→ 危険ドラッグ

初期表示はイチゴの香り物質 (R)-(+)-フラネオール（(R)-(+)-furaneol）；上掲書p.245

p.3ほか 水／p.23ほか 二酸化炭素／p.211 メタン：氷構造の例（n=28）　水，メタン，二酸化炭素の同時表示　→ メタン，アンモニア，水 p.22ほか ダイヤモンド／黒鉛：炭素（C）の同素体：ダイヤモンド，黒鉛（グラファイト），フラーレン（C60），カーボンナノチューブ（アームチェア型の例）　→ 2014年は世界結晶年！ p.26 二酸化ケイ素／p.55 石英：左水晶　右水晶　→ 二酸化ケイ素の結晶構造 p.48ほか アミノ酸：アミノ酸20種全表示　→ 20種類のアミノ酸 p.56ほか アデノシン三リン酸（ATP）：アデノシン三リン酸（adenosine triphosphate，ATP）　→ 生体分子の構成元素 p.79ほか ニトロゲナーゼ／モリブデン／根粒菌：6h73の6量体（Chain A・B×3；窒素固定菌アゾトバクター・ヴィネランディのモリブデン貯蔵タンパク質）　FUQ（Mo5クラスター）選択　GUH（Mo6クラスター）選択　同PDBsumデータ6h73_FUQ$　同PDBsumデータ6h73_GUH$　→ モリブデン化合物，タングステン化合物を含む生体分子のSITE例 p.98 ストリゴラクトン：ソルゴラクトン（sorgolactone；ストリゴラクトンの例） p.100 クロロゲン酸：クロロゲン酸（chlorogenic acid） p.100 コーヒー酸：コーヒー酸（caffeic acid） p.101 セルロース：セルロース（cellulose）　同（セロビオース単位（繰り返し単位）×2）　→ 代表的な高分子 p.101 グルコース：β-グルコース（β-glucose；重合してセルロース）　α-グルコース（α-glucose；重合してアミロース）　→ 別トピック p.101 66ナイロン：66ナイロン　6ナイロン　→ 代表的な高分子 p.101ほか セルラーゼ：セルラーゼ構造例　1g0c（アルカリセルラーゼ；セロビオース結合）　同PDBsumデータ1g0c_BGC-BGC$　→ 別トピック p.106 ジャスモン酸：ジャスモン酸（jasmonic acid；異性体あり） p.112 ストレプトマイシン：ストレプトマイシン（streptomycin）　→ 抗生物質分子データ集 p.114 イベルメクチン：イベルメクチンB1a（ivermectin B1a）　→ 別トピック p.201 亜酸化窒素：亜酸化窒素（nitrous oxide）　→ 別トピック p.245 フラネオール：(R)-(+)-フラネオール（(R)-(+)-furaneol） （今後も追加します） バックボーン　二次構造　DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　DNA/RNA選択　同backbone選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） ヒトの必須・非必須区別 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

炭素（C）の同素体
ダイヤモンド，黒鉛（グラファイト），フラーレン（C₆₀），カーボンナノチューブ（アームチェア型の例）

左水晶と右水晶

  
モリブデン貯蔵タンパク質6h73 6量体（Chain A・B×3）のMo₅クラスターとMo₆クラスター部分の拡大およびそれぞれのPDBsumデータ

；セロビオースが結合したアルカリセルラーゼ1g0cとPDBsumデータ

(R)-(+)-フラネオール（(R)-(+)-furaneol）

非リボソームペプチド合成酵素9bffとPDBsumデータ

  
左から アドヒビン（adhibin），アドヒビン類縁体結合のRhoGAPクラスIXミオシン6z2sとPDBsumデータ