GMPCPPが結合した細菌細胞分裂タンパク質FtsZとZapAの複合体9iskのChain A・B・F・G・H・I・JとPDBsumデータ

ポリエチレン（繰り返し単位×10，ねじれ構造の例）

p.15ほか（DNA）：（以下はDNA部分構造例）　→ DNAとRNAのいろいろな姿 1gt0のChain A・B（Oct4・Sox2・DNA 複合体；DNAのみ）　→ Oct1/Sox2/DNA 複合体 DNA部分構造例（mol形式データは塩基色表示ができません）　H原子消去 A-Tx2_G-Cx2　　A-T_G-C（mol形式；以下の2データの同時表示） A-T　同mol形式 G-C　同mol形式 p.91（ポリエチレン）：ポリエチレン（polyethylene，繰り返し単位） ｜ 繰り返し単位×10（ねじれ構造の例）　→ 代表的な高分子 p.97（ピレン、フルオランテン、フェナントレン）：ピレン（pyrene） ｜ フルオランテン（fluoranthene） ｜ フェナントレン（phenanthrene）　→ 参考：ポリアセン（polyacene）の例 参考（フェナントレン結合タンパク質例）：2hmk（フェナントレンが結合したナフタレン-1,2-ジオキシゲナーゼ）　同PDBsumデータ2hmk_PEY$　［Naphthalene 1,2-dioxygenase - Wikipedia］ p.98（ブタン）：ブタン（butane，アンチ型配座） ｜ 同（重なり型配座の例）　→ 分子の科学 p.117（MDMA）：MDMA（3,4-methylenedioxy-N-methylamphetamine）　→ 危険ドラッグ p.118（テトラヒドロカンナビノール）：テトラヒドロカンナビノール（tetrahydrocannabinol），Δ9-THC　→ 危険ドラッグ p.157（フェノール）：フェノール（phenol）　→ アルコールとフェノール p.157（クロロホルム）：クロロホルム（chloroform；trichloromethane）　→ 気候変動と適応 （今後も追記します） バックボーン　二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ） 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色　炭素色を●に 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） ヒトの必須・非必須区別 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

DNAの3Dプリンタ模型

ポリエチレン（polyethylene，繰り返し単位×10；ねじれ構造の例）

      
左から ピレン（pyrene），フルオランテン（fluoranthene），フェナントレン（phenanthrene）
右端は他の多環芳香族炭化水素例のベンゾ[ghi]ペリレン（benzo[ghi]perylene）とコロネン（coronene）（●は炭素）
→ 北海道石

参考（フェナントレン結合タンパク質例）：ナフタレン-1,2-ジオキシゲナーゼ2hmkとPDBsumデータ

  
MDMAと同分子やテトラヒドロカンナビノール（Δ⁹-THC）など危険ドラッグ同時表示
→ 危険ドラッグ｜MDMAほか結合タンパク質構造例

γ-デカラクトン（γ-decalactone）

リード化合物Ligand 94が結合したブロモドメインタンパク質4（BRD4）9ht1のChain BとPDBsumデータ

セペタプロスト（sepetaprost）

プロテオロドプシンNM-R1−ミクソール（myxol）複合体9jovのChain AとPDBsumデータ

  
［左］ギレデストラント（giredestrant）
［右］イムルネストラント（imlunestrant）

パリトキシン（palytoxin）が結合したNa⁺,K⁺-ATPアーゼ9vj0のChain A・B・GとPDBsumデータ

  
［左］タンパク質KIBRA構造例6fjc
［右］PKMζ構造例AlphaFold構造 Q05513