ATMキナーゼ 5np0

  
［左］がん治療薬候補 AOH1996
［中・右］AOH1996誘導体のAOH1996-1LEが結合した増殖細胞核抗原（PCNA）8glaとそのPDBsumデータ（AOH1160-1LE結合の8gl9との比較）

  
［右］セファゾリンナトリウム（cefazolin sodium）　［右］セファゾリン（cefazolin）

阻害剤イロマスタット（ilomastat；GM6001）が結合した蛇毒メタロプロテアーゼ（SVMP）2dw0とそのPDBsumデータ

紅花色素のカルタミン（カーサミン，carthamin）

p.2イラスト　タマネギの皮：タマネギの皮の色素ケルセチン（quercetin） p.3イラスト　水晶：左水晶（left-handed quartz crystal） ｜ 右水晶（right-handed quartz crystal）　→ 分子の科学｜二酸化ケイ素の結晶構造 p.11・26　金：金の結晶構造　→ 川上モデル｜分子・結晶・リガンド模型 ｜ 2014年は世界結晶年！ p.15　硫化鉄鉱：黄鉄鉱（pyrite；硫化鉄鉱の例）の結晶構造　→ 川上モデル｜分子・結晶・リガンド模型 p.24ほか　染料／合成染料：　→ 染料の種類 p.26・37・ポスター　インジゴ：インジゴ（indigo；C.I.Vat Blue 1，水不溶） ｜ 参考 インジゴホワイト（indigo white；C.I.Reduced Vat Blue 1，水溶性）　→ 染料の種類 p.28・ポスター　貝紫：チリアンパープル（tyrian purple；6,6'-dibromoindigo） p.30ほか・ポスター　紅花：カルタミン（カーサミン，carthamin）　→ 紅花の色素カルタミン p.34・36ほか・ポスター　アカネ／アリザリン：アカネの色素成分例アリザリン（alizarin；C.I.Mordant Red 11）　→ 染料の種類 ポスター　モーブ：モーブ（モーベイン；mauve，mauveine；C.I.50245）　モーベインA（mauveine A） ｜ モーベインB（mauveine B）　→ 染料の種類 ポスター　ウコン：ウコンの色素クルクミン（curcumin）　→ カレーの色素・クルクミン （今後追加します） バックボーン　二次構造 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ） 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

    
左から タマネギの皮の色素ケルセチン（quercetin），水晶（左水晶と右水晶），金（結晶構造）

    
左から 黄鉄鉱（pyrite；硫化鉄鉱の例）結晶の例とその構造，インジゴとインジゴホワイト，チリアンパープル（tyrian purple）

    
左から カルタミン（カーサミン，carthamin），アカネの色素成分例アリザリン（alizarin），モーベインA（mauveine A）とモーベインB（mauveine B）

ウコンの色素クルクミン（curcumin）

  
合成染料関連参考図：［左］酸性染料Orange II（酸性染料C.I. Acid Orange7）の合成ページから
［右］染料分子を含むPDBsumデータ例　→ PDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性

      
左から トリゴネリン（trigonelline），カフェイン（caffeine），テオブロミン（theobromine），ゲニステイン（genistein）

  
※参考図　［左］カフェインが結合したアデノシンA_2A受容体3rfmのPDBsumデータ
［右］ゲニステインが結合したエストロゲンレセプターα1x7rのPDBsumデータ

ジピリダモール（dipyridamole）が結合したアニオン交換輸送体1（AE1）8t6uのChain AとそのPDBsumデータ

阻害剤asundexianが結合した凝固XI因子8bo3とそのPDBsumデータ

    
左から カフェインが結合したAlphaFill構造 Q8NGI9（嗅覚受容体OR5A2）とその該当PDBデータ例5mzp（アデノシンA_2A受容体），両者のPyMOLによる重ね合わせ，およびそれぞれのPDBsumデータ

  
ムスク系香料分子の例（左から ムスクケトン，ムスクキシロール，ムスコン）とそれらの有機概念図上のプロット

阻害剤N,N'-ジアセチルキトビオース（N,N'-diacetylchitobiose）が結合したリゾチーム8cwhとそのPDBsumデータ