狂犬病ウイルス粒子中のLタンパク質ｰPタンパク質複合体6ueb
（右はLタンパク質のNPYNE配列［残基番号1929-1933］近傍の拡大図）

表　いろいろなウイルス（DNAウイルスとRNAウイルス）
◎以下を編集：吉開泰信 編，「ウイルス・細菌と感染症がわかる」，p.37，羊土社(2004)
（ ）は新興感染症の出現年：竹田美文・岡部信彦，「SARSは何を警告しているのか」，岩波ブックレット(2003)
SARS-CoV-2ほかを加筆；なお以下の分類等は変更になっている場合もある

	分類	例
主なDNAウイルス	ポックスウイルス科	エムポックス〈mpox，サル痘〉（1970）　→ 別トピック
	ヘルペスウイルス科	※鯉ヘルペス
	アデノウイルス科
	パピローマウイルス科 （ポリオーマウイルス科も酷似）	子宮頸がん；ヒトパピローマウイルス〈HPV〉による　→ 別トピック
	ヘパドナウイルス科 #	B型肝炎
	パポバウイルス科
主なRNAウイルス	パラミクソウイルス科	麻疹，ニパウイルスによる脳炎（1998）
	オルトミクソウイルス科 （オルソミクソウイルス科）	インフルエンザ　→ 鳥インフルエンザ（高病原性H5N1型は1959年）＆新型インフルエンザ情報
	コロナウイルス科	SARS（2002） → SARSと抗ウイルス薬 SARS-CoV-2（2019） → 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2｜COVID-19）情報
	アレナウイルス科	ラッサ熱
	レトロウイルス科 #	〈逆転写，レンチウイルス属〉AIDS（1983） → HIVとエイズ 〈一本鎖，デルタレトロウイルス属〉HTLV-1関連症候群（1980） → HTLV-1情報
	フィロウイルス科	エボラ出血熱（1977） → 2014年にエボラ出血熱感染拡大
	レオウイルス科	ロタ
	ピコルナウイルス科	ポリオ，A型肝炎
	カリシウイルス科	ノロ
	ラブドウイルス科	狂犬病
	フラビウイルス科 （トガウイルス科も酷似）	日本脳炎，ウエストナイル熱，デング熱，ジカウイルス感染症， C型肝炎（1989）　→ 別トピック〈B型肝炎記事含む〉 ※豚コレラ
	ブニヤウイルス科

# 最近のICTVレポートでは，ヘパドナウイルス科とレトロウイルス科は，『逆転写を行うDNAおよびRNAウイルス』として同じカテゴリに分類されている。
※参考：デビッド・クアメン 著・甘糟智子 訳，「スピルオーバー ウイルスはなぜ動物からヒトへ飛び移るのか」，明石書店(2021)
※参考：ウイルス図鑑，ウイルスの分類 - Wikipedia

タカアミラーゼ6taa
［Amylase - Wikipedia］

表紙・p.207：6taa（タカアミラーゼ）　同PDBsumデータ6taa_CA[479(A)] p.6（α-トコフェロール）：α-トコフェロール（α-tocopherol，ビタミンE〈トコフェロールおよびトコトリエノールそれぞれにα～δあり〉）　→ ビタミン p.33（分配）：マラチオン（malathion）　シマジン（simazine，CAT）　p,p'-DDT　o,p'-DDT　2,4,5-T　2,4-D　2,3,7,8-TCDD〔ダイオキシン類〕　ビスフェノールA（bisphenol A，BPA）　フタル酸ジエチル（diethyl phthalate，DEP）　フタル酸-2-ジエチルヘキシル（di-2-ethylhexyl phthalate，DEHP）　p-ノニルフェノール〔p-nonylphenol；直鎖，他に分岐型あり〕　テストステロン〔testosterone，男性ホルモン〕　17β-エストラジオール〔17β-estradiol，女性ホルモン〕　　→ 環境ホルモンとして疑われている化合物例 p.67（サッカリン）：サッカリン（saccharin）　→ 甘味物質の秘密 p.71（ルミノール反応）：ルミノール（luminol）　3-アミノフタル酸（3-aminophthalic acid；化学発光は3-アミノフタル酸イオンによる〈励起一重項状態〉） p.71（標準臭液）： β-フェニルエチルアルコール（β-phenylethylalcohol）　メチルシクロペンテノロン（methyl cyclopentenolone）　イソ吉草酸（isovaleric acid，3-メチルブタン酸〈3-methylbutanoic acid〉）　γ-ウンデカラクトン（γ-undecalactone）　スカトール（skatole，3-methyl-1H -indole）　→ 香りの分子事典｜悪臭の正体 p.77（フェノールフタレイン）：フェノールフタレイン（pH＜8.3，無色）　フェノールフタレイン（pH = 8.3-11.0，赤色［λmax = 552 nm］）　フェノールフタレイン（pH＞11.0，無色）　→ フェノールフタレインの色 p.89ほか（紫外・可視分光）：オキシベンゾン（oxybenzone）　→ 別トピック ｜ クロロフィルaの参考データとしてPDBsumデータ3arc_CLA[607(A)]　→ 川上モデル ｜ 食用赤色102号（C.I.Acid Red 18）　→ 染料の種類 ｜ リコピン（リコペン，lycopene）　→ モノはなぜ見える p.92（蛍光分析／GFP）：1hcjのChain A（green fluorescent protein）　→ 緑色蛍光タンパク質／GFP p.95（赤外分光／分子の振動）：水の逆対称伸縮　アニメーション　→ その他の振動：二酸化炭素と水の分子振動 p.96（赤外分光，セルロースのスペクトル）：セルロースの部分構造〔グルコース環×4，セロビオース単位（繰り返し単位）×2〕　→ 代表的な高分子 p.153（ポリジメチルシロキサン）：ポリジメチルシロキサン（polydimethylsiloxane，PDMS；シリコーンの部分構造）　→ 代表的な高分子 p.171（LC/MSによる分析例）／p.192（PFAS）：PFOS（パーフルオロオクタンスルホン酸，perfluorooctanesulfonic acid）　PFOA（パーフルオロオクタン酸，perfluorooctanoic acid）　PFHxS（パーフルオロヘキサンスルホン酸，perfluorohexanesulfonic acid）　→ PFAS問題 p.206ほか（DNA分析／コドン／アミノ酸）：DNA部分構造例　→ DNAとRNAのいろいろな姿　mRNA（UUUUUUUUUUUU；ニーレンバーグの実験）　→ コドンと遺伝暗号表　アミノ酸20種全表示（有機概念図I/O値順，pdb形式）　→ タンパク質中の20種類のアミノ酸 p.211（ウイルス検査）：5u4wの360量体（Chain A-F×60，α炭素とリガンドのみ；ジカウイルスの構造例）　→ ジカウイルス （今後も追記します） バックボーン　二次構造 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ） 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　∥　Jmol色　Rasmol色 リガンドの元素記号表示 糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） ヒトの必須・非必須区別 水素結合表示 S-S結合表示（太）　S原子（Protein中）空間充填 ドット表面表示　α炭素ラベル表示　回転 背景・黒　灰　白　紺

  
表紙・p.207：タカアミラーゼ6taa（左はJmolカラー，右はPyMOLカラー）

pp.2-3「分析手法マップ」／p.85（電磁波の種類と特徴）：
電磁波を使う分析（γ線～マイクロ波）の参考図として光（電磁波）の波長とエネルギー
→ 2015年は国際光年！

  
p.33（分配）：［左］オクタノール/水 分配係数（log P_OW）説明図　→ Log Pをポケットに！
［右］環境ホルモンとして疑われている化合物のlog P_OW
→ 環境ホルモンとして疑われている化合物例

  
p.71（標準臭液）：［左］香り分子の有機概念図
［右］悪臭防止法規制22化合物の有機概念図
◆：窒素化合物，■：硫黄化合物，●：アルデヒド，▲：酸・エステル・ケトン，●：アルコール，◆：芳香族炭化水素
→　有機概念図計算Excelシートの解説

p.67（サッカリン）：甘味物質と受容体の関係
→ 甘味物質の秘密

p.77（フェノールフタレイン）：
フェノールフタレイン（pH = 8.3-11.0，赤色［λ_max = 552 nm］）
→ フェノールフタレインの色

  
p.89ほか（紫外・可視分光）／p.86（ランバート・ベールの法則）／
p.90（紫外・可視分光スペクトル）／p.220ほか（検量線）／p.230（最小二乗法）：
［左］可視吸収スペクトル測定とその計算（OrangeIIを例に）
※紫外・可視分光スペクトル図は自作N₈₈BASICプログラム（現在利用不可）による
［右］同プログラムが有していた直線回帰式・相関係数算出や多項式近似曲線描出等の機能による2次元グラフ表示例

p.92（蛍光分析／GFP）：
緑色蛍光タンパク質（GFP；green fluorescent protein）1hcjのChain A
→ 緑色蛍光タンパク質／GFP

p.95（赤外分光／分子の振動）／p.31（極性分子・無極性分子）：
二酸化炭素と水の振動（Chime版分子表示で作成のため現在利用不可）
※それぞれ上から全対称伸縮振動，逆対称伸縮振動，変角振動とそれを引き起こす赤外線の波数の実測値と計算値
→ 分子モデル可視化ツールChimeを使った化学教育

p.96（赤外分光，セルロースのスペクトル）：セルロースのIRスペクトル（綿布，KBr法）

  
p.102（マイクロプラスチック）：［左］プラスチックの部分構造例（ポリエチレン，PE）
［右］マイクロプラスチックに吸着する可能性がある分子の有機概念図
→ マイクロプラスチック問題

p.122（Ｘ線回折）：SPring-8のタンパク質構造解析の心臓部

p.171（LC/MSによる分析例）／p.192（PFAS）：PFAS例のPFHxSとPFOS
→ PFAS問題

p.211（ウイルス検査）：
ジカウイルスの構造例5u4wの360量体（Chain A-F×60；α炭素とリガンドのみ）
→ ジカウイルス
※上掲書のSARS-CoV-2（新型コロナウイルス）に代えて（SARS-CoV-2の全体構造PDBデータ未出のため）

  
［左］アスピリン（Aspirin；アセチルサリチル酸 acetylsalicylic acid）
［右］TXA₂（トロンボキサンA₂，thromboxane A₂）

トロンボキサンA₂受容体構造例6iiuとPDBsumデータ（ラマトロバン〈ramatroban〉が結合）

ARHGEF1の構造例3odwのChain A

C7ProPheが結合したシトクロムP450，P450BM3 9kt5のChain A

  
［左］アポリポタンパク質B-100とLDL受容体9bdtのChain A・R（B-100とレゴボディのみ）
［右］アポリポタンパク質A-I 9mxzのChain A・E